Memasuki babak kedua, Shin Tae Yong memutuskan melakukan penyegaran dengan melakukan pergantian pemain. Posisi Ernando Ari, Asnawi Mangkualam, Shayne Pattynama dan Ivar Jenner digantikan Muhammad Adi Satryo, Muhammad Ferrari, Pratama Arhan serta Ricky Kambuaya.
Tanzania mendapatkan peluang terlebih dahulu pada babak kedua melalui tendangan Yusuph Ally Kagoma dan masih dapat diamankan kiper Adi Satryo. Negara asal Afrika tersebut kembali mendapat peluang emas lewat tendangan Waziri Muhudi, namun dapat kembali dipatahkan Adi Satryo.
Lini pertahanan Indonesia kembali mendapatkan ancaman, kali ini lewat sundulan Ben Antony Starkie, beruntung bola mengarah tepat ke pelukan Adi Satryo.
Shin Tae Yong kembali melakukan pergantian pemain. Kali ini Nathan Tjoe A On, Egy Maulana Vikri dan Dimas Drajad menggantikan Thom Haye, Rafael Struick dan Ragnar Oratmangoen.
Pergantian ini hampir menciptakan gol, andai sontekan bola dari Egy Maulana Vikri hasil umpan Marselino Ferdinan tidak membentur mistar gawang Tanzania.
